Des comités de gestion conjoints fédéraux-provinciaux et fédéraux-territoriaux ont été établis dans chaque sphère de compétence pour favoriser le Programme infrastructures Canada (PIC) au niveau régional. Ce sont des ministères et organismes régionaux fédéraux qui doivent, sous la direction de ces comités, administrer le programme dans chacune des jurisdictions.

Les organismes chargés de la mise en œuvre du programme sont les suivants :

• Agence de promotion économique du Canada atlantique (pour la Nouvelle-Écosse, le Nouveau-Brunswick, l'Île-du-Prince-Édouard et Terre-Neuve et Labrador).
  
  
• Développement économique Canada (pour les régions du Québec).
  
  
• Affaires indiennes et du Nord Canada (pour le Yukon, les Territoires du Nord-Ouest, le Nunavut et les Premières nations).
  
  
• Industrie Canada (pour l'Ontario)
  
  
• Diversification de l'économie de l'Ouest Canada (pour la Colombie-Britannique, l'Alberta, la Saskatchewan et le Manitoba).

Infrastructure Canada assume le leadership et la coordination du PIC au plan national. Plus spécifiquement, il assume les tâches suivantes : prestation de conseils et d’aide à la ministre responsable de l’infrastructure, formulation d’orientations opérationnelles et stratégiques, gestion d’information, rapports, planification des communications et coordination, et vérification et évaluations.