L'unité des technologies de l'ADN

L'unité des technologies de l'ADN est une installation de base de séquençage de l'ADN et de synthèse de l'ADN, de gènes et de peptides, qui a été établie par l'IBP en 1988. Avec le développement des technologies de « microarray » et de la bioinformatique comme outils clés dans la découverte rapide de l'expression génétique et de la fonction des gènes, le séquençage de l'ADN à haut débit est devenu une technologie essentielle. L'unité offre des capacités de séquençage à haut débit pour appuyer des programmes de génomique agricole, des projets de base de l'IBP et des projets collaboratifs. Le groupe a intégré la préparation de modèles enzymatiques de plasmides in vitro et les technologies de séquençage à haut débit avec résolution de séquence sur une analyse de séquençage de l'ADN AB-3730xl à 96 capillaires. La capacité de débit s'élève à 5760 longueurs de séquence par semaine, dont les étendues varient entre 800 et 1000 (cote de Phred 20). Non seulement l'unité offre un appui à l'IBP et aux projets collaboratifs, elle fournit aussi des technologies de séquençage de l'ADN et de synthèse de l'ADN/de gènes aux universités, aux secteurs industriels et aux départements gouvernementaux.

Services

Notre unité de technologies de l'ADN offre une vaste gamme de services :

• La préparation de plasmides et le séquençage de l'ADN à haut débit de marqueurs de séquence exprimés (EST), de fragments de chromosomes, de gènes clonés et de produits PCR.
• La synthèse des gènes, les librairies de gènes et l'optimisation selon la préférence en codon
• Des oligonucléotides modifiés (bases modifiées fluorescentes, biotinylées, et phosphorylées)
• La synthèse des peptides

Équipement

Le laboratoire dispose des appareils suivants:

• Un analyseur de l'ADN par électrophorèse à capillaires AB-3730xl ciblant principalement les projets en génomique et les collaborations pour lesquels un format à 96 ou 384 puits est utilisé pour le séquençage à haut débit.
• Deux séquenceurs AB de l'ADN additionnels sont utilisés couramment pour rencontrer les besoins de séquençage sur commande de projets de séquençage de plus petite envergure.
• Quatre synthétiseurs de l'ADN Beckman Oligo 1000 capables de synthétiser sur commande des molécules de l'ADN d'une longueur de plus de 150 bases. L'unité fournit sur commande des synthèses de gènes, des librairies de gènes et des ajustements de préférence de codon en plus d'ADN modifiés tel que des oligonucléotides marqués par phosphorylation, biotinylation, ou fluorescence. Plusieurs modifications additionnelles sont disponibles sur commande.
• Un synthétiseur de peptides Rainin Symphony/Multiplex à 12 réactions
• Deux systèmes Dianex de chromatographie liquide à haute performance (CLHP) permettant la purification d'oligonucléotides, de produits PCR et de peptides synthétiques sur commande.

Taux

Ces services sont disponibles aux organismes externes selon le principe de la récupération des coûts. Les taux dépendent du type de service disponible. Des taux en gros sont disponibles pour la préparation de plasmides et le séquençage de l'ADN à haut débit et pour la synthèse d'oligonucléotides et de gènes.

Personnes-contact:

D^r Larry Pelcher (Meneur de groupe) à Larry.Pelcher@nrc-cnrc.gc.ca
Téléphone: (306) 975-5967.

Barry Panchuk (Séquençage de l'ADN) à Barry.Panchuk@nrc-cnrc.gc.ca
Téléphone: (306) 975-6073.

Inge Roewer (Séquençage de l'ADN) à Inge.Roewer@nrc-cnrc.gc.ca
Téléphone: (306) 975-6590.

Darrin Klassen (Séquençage de l'ADN) à Darrin.Klassen@nrc-cnrc.gc.ca
Téléphone: (306) 975-6145.

Don Schwab (Synthèse des oligonucléotides, des gènes et des peptides) à Don.Schwab@nrc-cnrc.gc.ca
Téléphone: (306) 975-4998.