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Technologies de l'intelligence artificielle

Extraction de données en génomique fonctionnelle (BioMine)

Image qui représente le projet BioMine - Cliquez sur l'image pour voir la pleine dimension.

Le projet BioMine a été lancé en août 1999 afin de répondre au besoin croissant de la bioinformatique (domaine qui marie informatique et biotechnologie) de traiter et d’analyser les grandes quantités d’information générées dans l’étude des gènes et des fonctions des protéines. À titre de projet conjoint avec l’Institut des sciences biologiques du CNRC (ISB-CNRC), le projet se concentre principalement sur le développement d’un outil d’exploration de données qui permettra le traitement rapide et précis des données des puces à ADN et des microréseaux de protéines. Le projet consiste en trois phases distinctes :

Phase I : Recherche préliminaire pour déterminer les besoins en exploration de données dans le domaine de la génomique et pour évaluer les techniques et outils d'exploration de données connexes sur le marché. Cette phase, qui a débuté en août 1999 et s'est terminée en janvier 2000, n'a pas permis de trouver un outil existant et intégré d'exploration de données permettant de satisfaire à tous les besoins en matière d'exploration de données issues des puces à ADN.
Phase II : Analyse des besoins, recherche, conception et mise en œuvre d'un outil d'exploration de données, appelé BioMiner. Au cours de cette phase, l'architecture du logiciel BioMiner, comportant une approche unique d'exploration de données en génomique, a été conçue et mise en application. Le logiciel sera également adapté à l'analyse des données protéomiques et métaboliques, deux domaines où la hausse de la production est imminente.
Phase III : Améliorations du logiciel BioMiner, accompagné de recherche étendue en génomique et études de cas au moyen d’ensembles de données en génomique publics et privés. Les études de cas serviront à valider davantage les outils existants et à identifier de nouvelles fonctionnalités. Cette phase a débuté en avril 2002 et continuera jusqu’en mars 2005.

Le projet BioMine a récemment mené à l’établissement d’un partenariat de trois ans avec le ministère des Sciences et de la Technologie (MCYT) de l’Espagne. Cet effort conjoint utilisera les résultats de la recherche du projet BioMine dans le développement d’un système d’aide à la décision. Cette base de connaissances exhaustive servirait d’un outil pour marier des flux multiples de données biomédicales d’une variété de sources, y compris d’autres données résultant d’expériences, des données des microréseaux et de l’information clinique et pour établir des correspondances entre ces données. En fin de compte, l’usage d’un tel outil produira d’autres progrès de l’identification des fonctions des gènes et des protéines connexes. De plus, cet outil permettra aux chercheurs médicaux d’analyser et prédire l’efficacité de nouvelles drogues dans le traitement de maladies et de diagnostiquer les maladies plus tôt et avec plus de précision.

Partenaires du projet :

Institut des sciences biologiques du CNRC (ISB-CNRC)
Institut de recherche en biotechnologie du CNRC (IRB-CNRC)
Institut de biotechnologie des plantes du CNRC (IBP-CNRC)
Institut des biosciences marines du CNRC (IBM-CNRC)
Centre hospitalier pour enfants de l’est de l’Ontario
Centro Nacional de Biotecnología – Consejo Superior de Investigaciones Cientificas (CNIB-CSIC)
Centro Nacional de Investigaciones Oncológicasc (CNIO)

Personne-ressource

Dr. Abolfazl Famili (Fazel)
Agent de recherche
Raisonnement intégré
Institut de technologie de l'information du CNRC
1200, chemin de Montréal
Édifice M-50, pièce 368
Ottawa, ON K1A 0R6
Téléphone : +1 (613) 993-8554
Télécopieur : +1 (613) 952-0215
Courriel : Fazel.Famili@nrc-cnrc.gc.ca

Personne-ressource pour les affaires

Dr. George Forester
Agent de développement commercial
Bureau de développement commercial, RCN
Institut de technologie de l'information du CNRC
1200, chemin de Montréal
Édifice M-50, pièce 203
Ottawa, ON K1A 0R6
Téléphone : +1 (613) 993-3478
Télécopieur : +1 (613) 952-0074
Courriel : George.Forester@nrc-cnrc.gc.ca