Pêches et Océans Canada travaille en étroite collaboration avec Parcs Canada, Environnement Canada et la Colombie-Britannique pour établir un réseau de zones de protection marine sur la côte canadienne du Pacifique. Cette mission que s’est donnée le MPO a fait l’objet d’un document stratégique publié en 1998 et intitulé « Stratégie des zones de protection marine sur la côte canadienne du Pacifique ». 

Depuis lors, le gouvernement fédéral s’est employé à développer des zones de protection du milieu marin dans le cadre de diverses structures législatives. Ainsi, Environnement Canada a entrepris de désigner les îles Scott réserve de faune marine, tandis que Parcs Canada travaille à la création d’aires marines nationales de conservation à Gwaii Haanas et dans la partie méridionale du détroit de Georgia. 

Pêches et Océans a également entrepris de créer  des zones de protection marine en vertu de la Loi sur les océans. Le projet de la zone de protection marine du champ hydrothermal Endeavour a récemment été annoncé par le ministre des Pêches et des Océans comme la première zone de protection à être créée en vertu de la Loi sur les océans. Dans le même temps, le MPO a continué de faire des progrès dans la désignation des secteurs du mont sous-marin Bowie et de Race Rocks comme ZPM. À terme, les secteurs désignés zones de protection marine en vertu de la Loi sur les océans seront sélectionnés dans le cadre de mécanismes de gestion intégrée.