La vérification interne est un service d'assurance indépendant et objectif conçu comme valeur ajoutée pour améliorer les opérations de l'Agence. Cette activité aide l'Agence à atteindre ses objectifs en présentant une approche disciplinée et systématique à l'évaluation et à l'amélioration de l'efficacité de la gestion du risque, du contrôle et des processus de gouvernance.

Les services d’assurance sont fournis par le biais de missions de vérification, qui permettent à leur tour de fournir à la présidente et aux autres hauts fonctionnaires de l’Agence des examens objectifs de la validité des stratégies et des pratiques de gestion du risque, des cadres et des pratiques de contrôle de gestion, et de l’information utilisée pour la prise de décision et l’établissement de rapports sur le rendement.

Les missions de vérification sont structurées en fonction des besoins particuliers de l’Agence, qui sont déterminés au moyen d’une analyse de l’évaluation des risques et de consultations auprès de la haute direction. Exemple des genres de missions exécutées :

• Vérification de la conformité - menée pour déterminer si l’Agence a respecté les politiques, les plans, les procédures, les lignes directrices, les règlements ou les contrats particuliers qui affectent l’organisation. Il faut avoir des critères établis qui serviront de base pour mesurer la conformité pour réaliser avec succès une vérification de la conformité.
• Vérification de la gestion du programme - constitue une évaluation indépendante, à l'intention de la direction, de la fonction de gestion d'un projet, des processus pour gérer les risques liés au projet et de la qualité du travail effectuée par la ou les équipes de gestion du projet.
• Vérification intégrée - est une combinaison de la vérification de la conformité et de la vérification de la gestion du programme.
• Révision/Étude - est habituellement entreprise par la direction pour examiner un enjeu spécifique relative à un programme, à une politique ou à une initiative. Elle fait appel à une méthodologie de vérification établie, mais n'exige pas l'application de pratiques de vérification rigoureuses.

L'APECA réalise aussi des évaluations du succès, de la pertinence et de la rentabilité de ses programmes et de ses initiatives. Ces rapports donnent à la direction de l'APECA de l'information objective, pertinente et en temps utile sur son processus décisionnel. L'Agence considère la mesure du rendement et le rapport d'évaluation comme deux éléments essentiels au bon développement durable des politiques, des programmes et des opérations.